1度は絶滅寸前までいき、そこから限られた犬たちから復元された犬種であるため、バーニーズマウンテンドッグは、骨格、関節などに先天的な障害を持っている場合が多い傾向がある犬種です。
特に急激に成長する子犬の時期にはしっかりと観察することが大切です。少しの異常からでも、病気の早期発見につながります。